何畅 , 杨锦昌 ^* , 余纽 , 刘振湘 , 覃国铭 , 陈朝黎

中国林业科学研究院热带林业研究所, 热带林业研究国家林草局重点实验室, 广州, 510520
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 27 篇   
收稿日期: 2019年03月04日    接受日期: 2019年03月11日    发表日期: 2020年05月26日

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油楠(Sindora glabra)作为极具开发潜力的能源植物，在分子水平上的研究仅局限于 ISSR 分子标记。本研究利用 Trinity 软件对油楠转录组数据进行组装，共得到总长为 48 307 806 bp 的 283 998 条 Unigenes。利用 MISA 软件寻找到 97 443 个含有 SSR 的重复基元。SSR 位点中主要重复序列为单核苷酸和二核苷酸，分别占总 SSR 位点的 67.68% 和 22.56%，其次是三核苷酸，占 8.54%。利用 Primer 3.0 设计引物，并从中随机选择 200 对引物进行 PCR 扩增，其中有 13 对扩增出清晰条带，多态性高，重复性好。油楠 SSR分子标记的开发对于研究其遗传多样性、重要性状基因定位及分子标记辅助选择育种等起到重要的推动作用。
 

油楠(Sindora glabra)；转录组；SSR；分子标记